水窗是指软X射线的波长范围处在2.34nm与4.4nm之间,前者对应氧原子的K吸收带,后者对应碳原子的K吸收带,即X射线光子能量范围在530eV到280eV间.在此范围内,水不吸收X射线,即水对X射线是透明的.但是,此范围内的X射线会被氮原子和其他构成生物机体的元素吸收,因此,该波长可用于对活体生物样本进行X射线显微。